Celera Genomics schließt die Sequenzierungsphase des Genoms eines Menschen ab

Celera Genomics schließt die Sequenzierungsphase des Genoms eines Menschen ab
Celera Genomics schließt die Sequenzierungsphase des Genoms eines Menschen ab
Anonim

Unternehmen beginnt mit der Sequenzierung des Mausgenoms

ROCKVILLE, MD - 6. April 2000 - Celera Genomics (NYSE: CRA), ein Unternehmen der PE Corporation, gab heute bekannt, dass es die Sequenzierungsphase des Genoms einer Person abgeschlossen hat und nun mit der Zusammenstellung der sequenzierten Fragmente beginnen wird das Genom in die richtige Reihenfolge, basierend auf neuen rechnerischen Fortschritten. Celera begann vor sieben Monaten, im September 1999, mit der Sequenzierung des menschlichen Genoms. Neben der Assemblierung wird sich das Unternehmen nun darauf konzentrieren, die Sequenzinformationen zu kommentieren und zusätzliche Daten über genetische Variationen zu sammeln.

Celeras Shotgun-Sequenzierungstechnik für das gesamte Genom umfasst die Sequenzierung von beiden Enden der doppelsträngigen klonierten DNA. Die genau gepaarten Klon-Endsequenzen von Celera sind ein Schlüsselwerkzeug, um das Genom viel vollständiger zusammenzusetzen, als es einzelsträngige Sequenzierungsmethoden bei vergleichbarer Sequenzabdeckung ermöglichen. Celeras Paired-End-Sequencing-Strategie als Teil der Whole-Genome-Shotgun-Sequencing-Technik hat nun Sequenzpaare von Klonen produziert, die das menschliche Genom elfmal abdecken. Das Unternehmen glaubt, dass 99 % des menschlichen Genoms in der geklonten DNA enth alten sind.

Celeras Strategie zur Sequenzierung des gesamten Genoms wurde durch die kürzlich erfolgte Veröffentlichung des Genoms von Drosophila melanogaster (Fruchtfliege), dem größten Genom, das bisher sequenziert und zusammengesetzt wurde, validiert. Drosophila ist ein sehr wichtiges Modell für die menschliche Biologie und Medizin. Nach dem Zusammenbau und der Annotation weisen die nicht repetitiven Regionen des Drosophila-Genoms eine Sequenzgenauigkeit von mehr als 99,99 % auf.

Celera hat die Phase der Sequenzierung des menschlichen Genoms abgeschlossen und mit der Zusammenstellung des Genoms begonnen, aber das Unternehmen wird weiterhin die menschliche Sequenzierung für die SNP-Diversität (Single Nucleotide Polymorphisms) und zum Schließen von Lücken durchführen. Die SNPs sind Einzelbuchstabenvariationen zwischen Menschen, die die Anfälligkeit für Krankheiten und die Fähigkeit zur Bekämpfung von Krankheiten bestimmen. Ein wesentliches Merkmal von Celeras Ansatz zur Sequenzierung des menschlichen Genoms ist die Verwendung von genetischem Material von Männern und Frauen unterschiedlicher ethnischer Herkunft. Wenn Celera in den nächsten Monaten die menschliche SNP-Sequenzierung abschließt, wird seine Genomdatenbank aus Daten von sechs Männern und Frauen mit unterschiedlichem, selbst identifiziertem ethnischem Hintergrund bestehen. Dieser Ansatz sollte es Celera ermöglichen, eine Datenbank zur Untersuchung der genetischen Variationen zwischen Individuen zu entwickeln, während gleichzeitig das Genom entschlüsselt wird. „Jetzt, da wir die Sequenzierung des Genoms eines Menschen abgeschlossen haben, werden wir unsere Rechenleistung der Aufgabe widmen, das menschliche Genom zu ordnen“, sagte J.Craig Venter, Ph.D., Präsident und Chief Scientific Officer von Celera. „Wir beabsichtigen, die Humandaten in einer Form zu vervollständigen und zu veröffentlichen, die mit dem hochwertigen Drosophila-Genom übereinstimmt, das Celera in Zusammenarbeit mit dem Berkeley Drosophila Genome Project erzielt hat. Dies wird voraussichtlich Forschern weltweit und unseren Abonnenten die Nutzung unserer Daten ermöglichen wichtige medizinische Fortschritte erzielen."

Celera startet Mausgenomprojekt

Celera hat jetzt mit dem Mausgenomprojekt begonnen, das von entscheidender Bedeutung für biomedizinische Forscher ist, die die Maus als Modell für Studien der Humanbiologie und -medizin verwenden. Ein wesentliches Merkmal des Geschäftsmodells von Celera wird die Möglichkeit sein, Genome verschiedener Organismen zu vergleichen (comparative genomics). Der Vergleich des Maus-, Drosophila- und menschlichen Genoms wird voraussichtlich viele neue Wege der Erforschung der Mechanismen der Generh altung und -regulierung eröffnen, was zu einem besseren Verständnis der Genfunktion und -krankheit führen könnte.

Celera-Meilensteine

Menschliches Genom:

Am 10. Januar 2000 gab Celera bekannt, dass es Daten zusammengestellt hat, die 90 % des menschlichen Genoms abdecken. Mit der heutigen Ankündigung ist Celera auf dem besten Weg, die Assemblierung und Annotation des menschlichen Genoms noch in diesem Jahr abzuschließen.

Drosophila melanogaster Genom:

Am 30. Dezember 1999 schloss Celera die Veröffentlichung der Drosophila-Genomsequenz für die öffentliche Datenbank ab. Nach umfangreichen wissenschaftlichen Analysen in Zusammenarbeit mit dem Berkeley Drosophila Genome Project (BDGP) und anderen Mitarbeitern veröffentlichten Celera und die öffentlichen Mitarbeiter die Manuskripte am 24. März 2000 in der wissenschaftlichen Zeitschrift Science. Celera und seine Mitarbeiter haben fast 14.000 Gene identifiziert im Genom, viele in kommerziell wichtigen Proteinfamilien, die sich bei der Entwicklung neuer Therapeutika und Insektizide als wertvoll erweisen sollten. Drosophila ist das größte bisher sequenzierte Genom und ist das erste Insekt und der erste Organismus mit einem zentralen Nervensystem, das sequenziert wurde.

PE Corporation umfasst derzeit zwei operative Gruppen. Die Celera Genomics Group mit Hauptsitz in Rockville, MD, beabsichtigt, die maßgebliche Quelle für genomische und verwandte medizinische Informationen zu werden. Die PE Biosystems Group (NYSE: PEB) mit Hauptsitz in Foster City, Kalifornien, und einem Umsatz von 1,2 Milliarden US-Dollar im Geschäftsjahr 1999, entwickelt und vermarktet instrumentenbasierte Systeme, Reagenzien, Software und vertragsbezogene Dienstleistungen für die Life-Science-Industrie und die Forschungsgemeinschaft. Informationen über das Unternehmen, einschließlich des Konzernabschlusses der PE Corporation, sind im World Wide Web unter http://www.pecorporation.com oder telefonisch unter (800) 762-6923 erhältlich.

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